前言¶
做网络毒理学研究时，经常需要比较两种暴露（exposure）对同一表型的共同作用机制。这种研究要同时完成靶点收集、共同与特异靶点拆分、富集分析、PPI网络构建、优先级排序、分子对接，甚至还要做转录组交叉验证和文献检索。这些步骤环环相扣，任何一个环节没做好，都会影响后续机制合成与发表。人工梳理这些流程既耗时又容易遗漏细节。
这是什么¶
这是一个用于生成比较网络毒理学研究设计的 Skill。由社区用户维护，属于专业分类。它从用户提供的暴露对、共享毒性表型和验证方向出发，自动生成包含研究方案、分步流程、绘图计划、验证层级、最小可执行版本、发表升级路径和文献检索策略的完整方案。
核心功能¶
- 多模式研究设计：支持五种研究模式，根据研究场景选择合适方案。
- 方案分级输出：始终输出 Lite / Standard / Advanced / Publication+ 四个版本，并给出推荐主方案。
- 分步流程指导：提供可执行的 stepwise workflow，覆盖靶点收集、共享与特异靶点分解、富集分析、PPI 网络优先级排序、分子对接等。
- 验证层级规划：给出从基础验证到深度验证的层次结构。
- 最小可执行版本：生成可直接运行的最小化研究流程。
- 发表升级路径：明确从最小版本到可发表版本的升级步骤。
- 文献检索策略：提供严格验证的文献检索方案，支持发表级研究。
安装与启用¶
该 Skill 来自社区，通过 SkillHub 平台分发。
- 在 SkillHub 平台搜索 Skill 名称：Comparative Network Toxicology Shared Mechanism Reference Grounded。
- 点击安装后，在支持的客户端（如 Cursor、Claude Code 等）中启用该 Skill。
- 启用后，该 Skill 将作为可用工具加载。
典型用法¶
在对话中提供以下信息，Skill 会返回完整研究设计方案：
- 两种相关暴露（exposure pair）
- 共享毒性表型（shared toxic phenotype）
- 验证方向（validation direction）
示例输入：
暴露对：甲醛和苯
共享毒性表型：DNA 损伤
验证方向：体外细胞实验
Skill 会输出：
- 推荐主方案（Lite / Standard / Advanced / Publication+）
- 分步 workflow
- 绘图计划（如网络图、富集图、PPI 图等）
- 验证层级
- 最小可执行版本
- 发表升级路径
- 文献检索策略
适用场景与注意¶
适合用于：
- 比较两种环境污染物或药物暴露的毒性机制
- 需要系统化开展网络毒理学研究的团队
- 需要快速产出可发表级别方案的研究者
注意：
- 该 Skill 依赖用户提供准确的暴露对和表型信息，输入质量直接影响输出质量。
- 文献检索策略需结合最新数据库和关键词进行调整，建议在实际研究中进一步验证。
- 分子对接等计算步骤仍需在本地环境完成，Skill 主要提供方案和流程指导。
短结尾¶
这个 Skill 将比较网络毒理学的多步骤研究流程标准化、流程化，帮助研究者在较短时间内产出从最小可执行版本到发表级方案的完整路线。官方地址：https://api.skillhub.cn/user_c7479c7a/comparative-network-toxicology-shared-mechanism-reference-grounded
