微生物組 / Microbiome:OTU 表的 alpha、beta 多樣性與稀疏度分析

本文介紹社區發佈在 SkillHub 上的 data-analysis 類 Skill「微生物組 / Microbiome」(@user_f4fc8899/bio-microbiome-integrated,版本 1.4.20)。它定位爲託管執行器:接受文檔化的 JSON 輸入,返回結構化內容,在提供相應輸入時可返回 Markdown,明確不跑上游本地工具鏈、不操作第三方賬號,交付物是經過校驗的服務端響應。核心功能只有三項:每樣本的 alpha 多樣性、樣本間用 Bray-Curtis 距離並給出 PCoA 座標的 beta 多樣性、以及對丰度表做稀疏化後的多樣性。安裝上只給出官方座標,頁面資料未提供可覈驗的安裝命令;元數據顯示 requires_api_key=false、pricing_type=alipay,說明無需 API Key 但走支付寶計費,調用前需確認費用與額度。由於資料中沒有字段級示例,字段名與取值範圍應以 SkillHub 頁面說明爲準。適用場景是希望在不同機器間得到一致口徑的常規多樣性評估;注意它不做分類學註釋和差異檢驗,稀疏度是抽樣式估計,樣本量差異會影響結果,OTU 表上傳前還要確認數據外發合規。

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