前言¶
做医学文献调研时,单靠 PubMed 或 Google Scholar 常有三类问题:预印本查不到、方法学文献(比如统计、影像、数据管理)被医学索引漏掉、跨库检索后需要手工去重。如果还要从 PDF 里提取正文和表格,工作量又上一档。下面介绍的这个 Skill 把这几件事收进一次调用。
这是什么¶
ct-literature(临床试验文献检索专家)是一个面向医学文献检索的 Agent Skill,坐标 @user_ff7413f5/ct-literature,社区来源(community),发布者 user_ff7413f5,当前版本 1.4.7,SkillHub 分类为 professional。
它解决的问题是:把多源文献检索、结果归一化合并去重、OA 全文 PDF 获取、PDF 结构化解析串成一条链路,供 Agent 直接调用,而不是让使用者分别写四个脚本。
需要说明的一处资料冲突:Skill 简介写的是「无 key 亦可使用」,而元数据标签里是 requires_api_key=true。这两点都记录在官方元数据中,实际使用时建议以安装时的提示为准。
数据源与检索能力¶
Skill 覆盖四类数据源,各有分工:
1、OpenAlex:学术文献的开放索引,覆盖面广,响应快,适合做主题检索和引文扩展。
2、Europe PMC / MeSH:医学领域索引,MeSH 主题词检索能提升查全率,是临床试验文献的主检索入口。
3、bioRxiv / medRxiv:生命科学与医学预印本,pubmed 索引滞后或未收录的早期结果在这里。
4、arXiv:方法学、计算、统计、工程类文献,补医学索引通常覆盖不到的那一部分。
四个源合并检索,等于把「正式发表文献 + 预印本 + 方法学广度」放进同一个查询里,减少单一索引的漏检。
输出能力¶
检索结果不是简单拼接,而是经过归一化处理:
1、按标题、作者、年份、DOI 等字段做实体对齐,合并同一文献的不同记录。
2、去重后输出统一格式的文献条目。
3、可产出 CSM 安全性定性子集,即从检索结果中筛出用于安全性定性分析的文献集合,便于后续做安全性综述或证据表。
4、对开放获取(OA)文献,协助获取 PDF 全文。
CSM 安全性定性子集这一项是面向药物警戒、临床试验安全性总结这类场景的,不是通用文献列表。
PDF 结构化解析¶
Skill 集成了 Docling 做 PDF 结构化解析。拿到 OA 全文后,不只是转成文字,而是按文档结构抽取正文、标题层级、表格等内容,便于 Agent 直接引用段落和数值,不用使用者再写一层解析逻辑。
安装与启用¶
该 Skill 基于通用 SKILL.md 格式,通过 SkillHub 分发。官方地址:
https://api.skillhub.cn/user_ff7413f5/ct-literature
页面地址:
https://www.skillhub.cn/skills/user_ff7413f5/ct-literature
在支持 SkillHub 的 Agent 环境(Cursor、Codex CLI、Claude Code 等)中,按其各自的 Skill 安装入口指向上面的地址即可,无需额外配置数据源凭证。
需要提醒的是:预抓取的官方资料里没有给出具体的安装命令行和配置字段。上面只是分发地址,不要照着编一条 install 命令。实际使用时以 SkillHub 页面当时的说明为准。
典型用法¶
Skill 内部聚合的四个数据源本身都有公开 REST 接口,可以先手工验证检索效果,再决定是否直接交给 Skill。
OpenAlex 按关键词检索:
curl "https://api.openalex.org/works?search=semaglutide%20safety&per-page=25"
Europe PMC 按 MeSH 主题词检索:
curl "https://www.ebi.ac.uk/europepmc/webservices/rest/search?query=MESH:%22Diabetes%20Mellitus%22&format=json&pageSize=25"
bioRxiv / medRxiv 检索预印本:
curl "https://api.biorxiv.org/covid19/01-01-2024/01-31-2024/0"
这三条命令验证的是底层数据源可用性,不是 Skill 自身的调用方式。Skill 的价值在于把四类检索结果归一化合并、去重,并接上 PDF 解析,省掉自己写对齐逻辑的时间。
适用场景与注意¶
适合:医学文献调研、临床试验安全性文献梳理、需要同时覆盖预印本和方法学文献的综述写作、需要批量获取 OA 全文并抽取结构化内容的 Agent 工作流。
注意:
1、元数据标签为 requires_api_key=true,与简介中「无 key 亦可使用」的表述不一致。若安装时提示需要 key,按提示补全即可;无 key 时建议先确认是否只走公开接口。
2、不保证所有文献都能拿到全文。只有 OA 文献能协助下载 PDF,订阅制期刊的全文仍需自行通过机构权限获取。
3、归一化去重依赖元数据质量,少数记录缺少 DOI 或标题拼写差异较大时可能不会被合并,重要文献建议人工复核。
4、arXiv 覆盖的是方法学广度,不等同于临床证据来源,不要把方法学文献当作疗效证据使用。
5、当前版本 1.4.7,来源为 community,使用前建议看一遍官方页面的更新说明。
小结¶
ct-literature 的价值在于把医学文献检索中散落的四件事——多源检索、归一化去重、CSM 安全性子集、OA 全文解析——收进一个 Skill,使用者不必自己拼脚本。官方地址:
https://api.skillhub.cn/user_ff7413f5/ct-literature
注:本文依据 SkillHub 官方元数据整理。抓取时评分与下载量在两处资料中分别记为 100000/3232 与 99063/3171,无法确认哪个为准,正文未引用具体数值。