前言¶
在腾讯健康组学平台（Omics）上跑蛋白质相关流水线时，常见情况是：应用入口分散在 ORI Collection 合集里，子应用名称和 Nextflow 参数不统一，对话里很难一次说清要导入哪一个、怎么提交任务。若把平台里其他公共应用、本地 WDL、COS 上的 NF 或项目内已有应用也混进同一套话术，Agent 容易选错 Skill 或给出不匹配的步骤。
下面介绍 SkillHub 上的 @tencent-adm/ori-collection-skill（腾讯 ORI 蛋白序列生成预测模型）。它只面向 ORI Collection (Nextflow) 这一公共应用合集的导入与运行；其他场景应改用 omics-task-skill。
这是什么¶
一句话定位： 腾讯健康组学平台 ORI Collection (Nextflow) 公共应用合集的专用运行助手 Skill。
维护方： 发布者为腾讯健康组学平台；Skill 坐标 @tencent-adm/ori-collection-skill，当前版本 1.0.5，来源为 enterprise，分类为 professional。SkillHub 标注 requires_api_key=false，安装本 Skill 本身不要求额外 API Key。
背景能力（合集所依托的系统）： ORI 是腾讯生命科学实验室自主研发的蛋白质设计系统，覆盖序列生成、结构与功能预测等模型。官方简介将其与主流蛋白质设计、结构功能预测方案对比时，强调准确率与推理速度等优势；具体数值与基准需以平台文档与模型说明为准，本文不展开未在 Skill 页列出的指标。
Skill 页已列出的 5 个子应用：
| 子应用 | 用途（按名称理解） |
|---|---|
| Generate Protein | 蛋白质序列生成 |
| USMFold Predict | 结构相关预测（USMFold） |
| Solubility | 溶解度 |
| Thermostability | 热稳定性 |
| Signal Peptide | 信号肽 |
本 Skill 不替代 Omics 控制台或 Nextflow 引擎，而是在 Agent 对话中把「选哪个 ORI 子应用、按合集规范导入与运行」收敛成可执行的指引。
核心功能¶
依据 SkillHub 页面与已抓取元数据，可核实的能力包括：
- 合集范围限定： 仅服务 ORI Collection (Nextflow) 合集内子应用的导入与运行，避免与
omics-task-skill的职责重叠。 - 子应用覆盖： 对齐上述 5 个 ORI 子应用名称，便于在对话中映射到合集内的具体应用。
- 触发识别： 当用户提到 ORI Collection (Nextflow)、ORI、蛋白质结构预测、跑合集、以及多种写法（如
ori-collection-(nextflow)、run ori collection (nextflow)等）时，应优先启用本 Skill 而非通用组学任务 Skill。
典型对话意图包括：在组学平台导入 ORI 合集某一子应用、按 Nextflow 流程提交运行、区分「ORI 合集」与「其他公共应用 / 本地 WDL / COS NF」等。
安装与启用¶
安装流程遵循 SkillHub 官方说明（skillhub.cn/install/skillhub.md）。Skill 页给出的安装提示为：根据该文档安装 @tencent-adm/ori-collection-skill。
1、检查或安装 SkillHub CLI¶
command -v skillhub && skillhub --version
若未安装 CLI，可使用完整安装（CLI + 默认 Skill）：
curl -fsSL https://skillhub-1388575217.cos.ap-guangzhou.myqcloud.com/install/install.sh | bash
仅需 CLI 时：
curl -fsSL https://skillhub-1388575217.cos.ap-guangzhou.myqcloud.com/install/install.sh | bash -s -- --cli-only
2、安装本 Skill 到当前 Agent 的 skills 目录¶
安装时必须用 --dir 指向当前 Agent 识别的 skills 目录，否则默认落在 ./skills/ 可能无法被加载。
skillhub install @tencent-adm/ori-collection-skill --dir <你的 skills 目录>
常用路径示例（以你实际环境为准）：
- Cursor：
~/.cursor/skills/ - Claude Code：
~/.claude/skills/ - Codex：
~/.codex/skills/或项目下的.agents/skills/
安装后按所用 Client 要求重启或刷新 Agent，使 Skill 生效。
3、在 Cursor 等环境中的等价做法¶
SkillHub 页面亦支持将下列提示词发给 AI，由 Agent 按安装文档完成安装：
请根据 https://skillhub.cn/install/skillhub.md，安装
@tencent-adm/ori-collection-skill。
这与 CLI 安装指向同一坐标，区别仅在于是否由 Agent 代为执行命令与选择 --dir。
典型用法¶
官方 Skill 页未提供逐步复制的控制台截图或 NF 参数表，典型用法应建立在 对话触发 + 合集边界 上：
- 明确要说「ORI Collection (Nextflow)」或 ORI 合集，并写出目标子应用，例如「在组学平台跑 ORI 的 Solubility」或「导入 Generate Protein」。
- 不要混用其他应用类型。 若任务是其他公共应用、本地 WDL、COS 上的 NF 或项目内已有应用，在对话中说明后应走
omics-task-skill，避免本 Skill 给出错误导入路径。 - 让 Agent 按 Skill 内 SKILL.md 规范 引导你在 Omics 侧完成合集子应用的导入与 Nextflow 运行；具体字段以平台当前界面与合集版本为准。
示例提问（示意，非官方固定模板）：
- 「要在腾讯健康组学平台跑 ORI Collection 里的 USMFold Predict，怎么导入和提交？」
- 「ORI 合集 Nextflow，做 Thermostability 预测，和通用公共应用有什么区别，该用哪个 Skill？」
适用场景与注意¶
适合谁
- 已在或计划使用腾讯健康组学平台，且工作流落在 ORI Collection (Nextflow) 合集内。
- 希望通过 Agent 统一记住 5 个子应用名称与「只用 ori-collection-skill、其他用 omics-task-skill」的分工。
限制与注意
- 范围硬边界： 本 Skill 仅服务上述合集；扩大到其他 Omics 应用时必须切换 Skill。
- 版本： 撰写时 SkillHub 显示版本为 1.0.5；子应用能力以平台内实际部署为准。
- 数据与合规： 蛋白序列与预测结果的处理须符合你方数据安全与平台合规要求；Skill 描述未替代平台用户协议。
- 统计信息： SkillHub 页展示的评分、下载量会变动；以 Skill 详情页 为准。
结尾¶
@tencent-adm/ori-collection-skill 把 ORI Collection (Nextflow) 五类子应用（序列生成、USMFold 预测、溶解度、热稳定性、信号肽）与专用运行助手绑在一起，并和 omics-task-skill 划清边界。若你的任务就在这套合集里，用 SkillHub 安装到当前 Agent 的 skills 目录后，在对话中直接点明 ORI Collection 与子应用名称即可。
- Skill API / 元数据：https://api.skillhub.cn/tencent-adm/ori-collection-skill
- SkillHub 介绍页：https://www.skillhub.cn/skills/tencent-adm/ori-collection-skill
