在 DeepSeek Harness (DSH) 的插件生态中，构建一个可追溯、结构化的研究过程是一个常见需求。传统的对话记录往往缺乏对证据链和假设演进的系统化管理。SciFork 是一个本地、Git 原生的生物医学研究图谱插件，它通过将研究过程映射为图谱，帮助开发者梳理问题、假设与证据之间的关系。
简介¶
SciFork 是一个为 DeepSeek Harness (DSH) 设计的插件。它将研究问题转化为连接的、可检查的研究图谱，支持基于文献证据的扩展，并保持项目文件的本地 Git 可审计性。该项目由用户 zhang-bin-98 维护，采用 MIT 许可证。
核心功能¶
插件提供以下能力：
- 图谱化研究：将开放式研究问题转化为连接的、可检查的研究图谱。
- 文献证据导入：通过 PMID 或 DOI 引入文献证据。
- 分离关注点：将研究团队的“结果”与“解释”及“未验证假设”分离。
- 视图切换：提供主视图以检查整个项目，或使用证据视图关注特定实体的直接断言。
- 文献驱动扩展：从当前焦点运行单步文献驱动的扩展。
- 本地快照：创建仅包含 SciFork 管理文件的本地 Git 快照。
安装与启用¶
安装前请确保环境满足以下要求：
- DSH
0.1.1-rc.2（SciFork 0.0.3 紧耦合该版本接口）。 - DSH Web 模式已配置为本地回环访问 (
127.0.0.1)。
执行安装命令：
dsh plugin --profile web add git+https://github.com/zhang-bin-98/sci-fork.git
安装完成后重启 DSH。
典型用法¶
- 启动 DSH Web 模式：
dsh --profile web
- 在 Chat 中初始化研究项目：
/research init
- 验证项目状态：
/research validate
注意事项¶
- 版本限制：SciFork 0.0.3 紧耦合 DSH 0.1.1-rc.2 的公共接口。
- 运行环境：插件设计用于在 DSH 回环 Web 服务器上本地运行。
- 数据安全：插件将文献、PDF、模型输出和项目 Markdown 视为不可信数据。它不会上传项目或添加云同步，也不存储完整的摘要或 PDF 内容。
- 隐私合规：在提交或分享研究项目之前，请检查其中是否包含 PHI（受保护健康信息）、PII（个人身份信息）或受限访问数据。
SciFork 适合需要在本地管理研究流程并确保证据链可审计的开发者。更多细节与源码请参考其 GitHub 仓库。
