dsh-bio-gem:在 DSH 里从细菌基因组构建并交付 GEM(SBML + 模型卡)
dsh-bio-gem(@dsh-bio/dsh-bio-gem)是 moonbowterfly 维护的 DeepSeek Harness 工作流插件,面向细菌全基因组输入,串联 CarveMe 或可选 gapseq 构建、COBRApy 验证与补洞,交付 SBML 与模型卡。文章说明与 dsh-bio-genie 的分工、npm/GitHub 安装命令、GEM_PYTHON 与 CarveMe+diamond 环境、gem_* 工具链及 loopback 集成端点,并提醒插件以 dsh 进程权限写盘,安装前需审阅源码与 MIT 许可证。
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