微生物组 / Microbiome:OTU 表的 alpha、beta 多样性与稀疏度分析

本文介绍社区发布在 SkillHub 上的 data-analysis 类 Skill「微生物组 / Microbiome」(@user_f4fc8899/bio-microbiome-integrated,版本 1.4.20)。它定位为托管执行器:接受文档化的 JSON 输入,返回结构化内容,在提供相应输入时可返回 Markdown,明确不跑上游本地工具链、不操作第三方账号,交付物是经过校验的服务端响应。核心功能只有三项:每样本的 alpha 多样性、样本间用 Bray-Curtis 距离并给出 PCoA 坐标的 beta 多样性、以及对丰度表做稀疏化后的多样性。安装上只给出官方坐标,页面资料未提供可核验的安装命令;元数据显示 requires_api_key=false、pricing_type=alipay,说明无需 API Key 但走支付宝计费,调用前需确认费用与额度。由于资料中没有字段级示例,字段名与取值范围应以 SkillHub 页面说明为准。适用场景是希望在不同机器间得到一致口径的常规多样性评估;注意它不做分类学注释和差异检验,稀疏度是抽样式估计,样本量差异会影响结果,OTU 表上传前还要确认数据外发合规。

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