生信报告生成:把分析结论整理成 Markdown 报告

前言

生信分析做完之后,结果通常散落在脚本输出、分析结论和若干二维表格里。要变成一份可以交付的报告,要么手工排版,要么写脚本拼 Markdown,格式和表格对齐都要反复调整。这个 Skill 做的事就是把已经写好的分析结论、章节文字和二维表格整理成一份结构化的 Markdown 报告,排版部分交给 Skill 处理,使用者只需要提供内容。

这是什么

「生信报告生成 / Bioinformatics reporting」是一个基于通用 SKILL.md 格式的 Skill,坐标 @user_f4fc8899/bio-reporting-integrated,发布者 user_f4fc8899,来源 community,分类 education,当前版本 1.4.23。

它解决的问题是:输入分析结论、章节文字和二维表格,输出整理好的 Markdown 报告。它不负责产生新的分析结果,分析还是要在上游完成。

核心功能

根据官方简介,这个 Skill 的能力是:

  • 把用户提供的分析结论整理成报告章节。
  • 把用户提供的章节文字按 Markdown 结构组织。
  • 把用户提供的二维表格渲染为 Markdown 表格。

输入内容全部由使用者提供,Skill 本身不带数据集、不做统计计算。

安装与启用

官方地址:https://api.skillhub.cn/user_f4fc8899/bio-reporting-integrated

SkillHub 页面:https://www.skillhub.cn/skills/user_f4fc8899/bio-reporting-integrated

需要说明的是:本次写作时官方页面无法访问,已抓取资料中也没有给出具体的安装命令和配置文件路径。因此这里不提供安装命令,以免给出无法核实的内容。按通用 SKILL.md 格式的惯例,启用方式是在支持该格式的 Agent 环境中把 Skill 目录配置进 Skills 加载路径,具体命令以官方页面恢复后给出的说明为准。

元数据方面,资料中记录 pricing_type=alipay,requires_api_key=false,即不需要 API Key。

典型用法

资料中没有提供官方示例命令,下面按 Skill 的定位描述使用方式:

1、准备好分析结论、章节文字和二维表格。表格内容应为二维结构,即行和列都明确。

2、把上述内容作为输入交给这个 Skill,要求按章节组织。

3、得到输出后检查 Markdown 结构,重点核对表格的列数和对齐,以及章节顺序是否符合你的报告逻辑。

由于 Skill 只做整理,步骤 3 的检查不能省略:素材本身有误时,Skill 不会纠正内容。

适用场景与注意

适合的场景:分析已经完成,需要把结论、文字说明和表格快速排版成 Markdown 报告,不想手工处理表格对齐和标题层级。

需要注意的地方:

  • Skill 不产生新的分析结论,上游分析仍需自行完成或另用其他工具。
  • 二维表格的列数在 Markdown 中必须保持一致,输入表格不规整时需要先整理。
  • 社区来源、分类 education 意味着维护力度和适用场景以发布者说明为准,使用前建议核对官方页面的最新版本说明。
  • 资料记录的评分为 100000,下载 1123,安装 0;安装数为 0 说明实际使用反馈样本很少,可靠性需要自行验证。

小结

这个 Skill 的价值在于把报告排版这一层从手工劳动中拿掉:分析结论、章节文字和二维表格交进去,Markdown 报告拿出来。适合已经做完分析、只差成稿的环节。官方地址:https://api.skillhub.cn/user_f4fc8899/bio-reporting-integrated

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