dsh-plugin-deep-paper-reading:单篇生物医学论文的结构化精读

在 DeepSeek Harness (DSH) 生态中,对单篇生物医学论文进行深度的、逐图逐实验的精读是一项常见需求。现有的做法往往依赖手动整理或通用工具,难以保证逻辑链的完整性与证据的严格边界。dsh-plugin-deep-paper-reading 插件通过打包一个专用的“文献精读模式”预设,填补了这一空白。

插件概览

  • 名称:dsh-plugin-deep-paper-reading
  • 所有者:1283011852
  • 类别:工作流
  • 许可证:MIT
  • 核心价值:对单篇生物医学文献做逐图、逐实验的结构化精读。

核心功能

该插件提供的预设主要具备以下能力:

  1. 结构化精读:对单篇生物医学文献做逐图、逐实验的结构化精读。
  2. 对应表生成:生成图注与正文对应表。
  3. 实验拆解:拆解每个实验的四要素(目的/设计与工具/结果/解读)。
  4. 逻辑链重建:重建逻辑链并分类转折。
  5. 证据边界:严格证据边界(不编造图号、数字、P值等)。
  6. 报告产出:按模板产出可直接用于 journal club 的报告。
  7. 导出支持:支持导出为 Word 文档。

安装与启用

方式 1:CLI 安装

如果你本地有 dsh CLI 环境:

dsh plugin --profile web add github:1283011852/dsh-plugin-deep-paper-reading

安装完成后重启 DSH,在预设选择器里就能看到 文献精读模式。

方式 2:Desktop 导入

建议桌面用户直接下载 .dshpreset 文件并在 DSH Desktop 中导入。这种方式完全不会触碰 profile 配置,更安全。

使用方法

  1. 新建会话,在预设选择器里选择 “文献精读模式”。
  2. 把 PDF 或 DOI 丢进去。
  3. 输入指令 “精读这篇”。

注意事项

  1. 依赖检查:本机需要有 Python 和 PyMuPDF 等工具链来解析 PDF。如果缺失,agent 会先提示,不会假装读过全文。
  2. 配置覆盖风险:使用方式 1 安装时,插件的 patch 会覆盖 agent-presets 行的整个 config。这意味着原本配置在 roots 里的预设目录可能会被替换。如果需要共存,需在 profile patch 中手动合并 roots。
  3. 适用场景:本插件仅适用于单篇文献的精读。不适用于多篇文献综述、正式同行评审或检索文献。
  4. 许可说明:技能本体未作任何修改,保留原作者 MIT 许可。
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