DeepSeek Harness 插件:dsh-academic-paper-search

DeepSeek Harness(DSH)采用“一切皆插件”的理念。在构建需要引用事实的智能体时,开发者面临集成多源学术数据的痛点。直接整合各数据库 API 既繁琐又难以维护。dsh-academic-paper-search 作为一个薄适配 Bundle,解决了这一问题。

是什么

这是一个面向 DSH 的 Academic Paper Search 插件,由 wp-a 维护。它是一个薄适配 Bundle,复用官方 @deepseek-ai/dsh-mcp-client 启动现有的 nature-academic-search Python MCP 服务。检索、去重、引用核验、引文图谱和导出仍由同一套运行时负责,不会复制第二份搜索逻辑。

核心能力

插件固定使用 academic_search namespace,提供以下工具:

  • mcp__academic_search__search_papers:论文检索
  • mcp__academic_search__get_paper_by_id:按 ID 获取论文详情
  • mcp__academic_search__get_citation:获取引用信息
  • mcp__academic_search__lookup_mesh:MeSH 查询

默认检索覆盖 Crossref、PubMed、arXiv、OpenAlex 和 Europe PMC,并按 DOI、PMID、PMCID、arXiv ID、OpenAlex ID 去重。ClinicalTrials.gov 使用 entity_type=trial 单独查询,不与论文记录混合。调用 get_paper_by_id(include_relations=true) 可获取 references / cited_by 引文关系。

安装与启用

前置准备:
- Node.js >= 22.19 和 pnpm(DSH 用它管理 profile 插件)
- DeepSeek Harness(@deepseek-ai/dsh)
- uv 提供的 uvx,并已加入 PATH
- 用于 NCBI 请求的联系邮箱

安装命令:

npm install --global @deepseek-ai/dsh pnpm
export PUBMED_EMAIL=researcher@example.com
dsh plugin --profile web add dsh-academic-paper-search
dsh web

安装后需要重启目标 profile 才会挂载 Bundle。Python 服务由 MCP client 在 profile 激活时按需启动,查看包信息本身不会发起网络请求。

无界面运行可以使用 headless profile:

dsh plugin --profile headless add dsh-academic-paper-search
dsh --profile headless

典型用法

  1. 使用 search_papers 进行论文检索
  2. 调用 get_paper_by_id(include_relations=true) 获取引文关系
  3. 使用 lookup_mesh 进行 MeSH 查询

环境变量与凭据

Bundle 会把下列变量转发给 Python MCP 进程。值来自启动 dsh 的环境,不会写入本包:

变量 用途
PUBMED_EMAIL PubMed 请求必需
NCBI_API_KEY 可选,提升 NCBI 速率上限
CROSSREF_MAILTO 可选,进入 Crossref polite pool
OPENALEX_API_KEY 可选,提升 OpenAlex 配额
SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY 可选,提升 Semantic Scholar 配额

显式转发是有意设计:DSH 会清理子进程继承环境中形似凭据的变量,Bundle 的显式配置才会保留它们。空值安全,对支持匿名访问的来源不会造成额外影响。

适用场景与注意

适用场景:
智能体需要在 DSH 环境中进行跨库、带去重功能的学术文献检索。

注意事项:
1. 本包不替代学术数据库,也不会把模型输出自动当作引用事实。报告应保留 sources_succeeded、sources_skipped、errors 和核验状态。
2. 本包不增加第二套搜索实现。发布新 Python 版本时,应同步更新 Bundle 的 --from nature-academic-search==... 固定版本。
3. 本包不连接 Google Scholar、Web of Science、Scopus、Embase、CNKI 或万方。
4. 本包不要求可选的 WPIRONMAN AI 中转。中转可以辅助 workflow 计划或摘要级初筛,但不是学术来源,也不会参与 MCP 事实检索。
5. 需要可复现部署时,请固定 Bundle 版本,并在更新前审阅 nature-academic-search==0.3.0 这一行。

结语

dsh-academic-paper-search 将现有的 nature-academic-search Python 服务适配进 DSH 生态,为智能体开发提供了标准化的文献检索接口。更多细节可查看 GitHub 仓库。

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